个人简介

Personal Profile

中国医学科学院苏州系统医学研究所研究员，PI。重大疾病共性机制研究全国重点实验室核心成员。博士毕业于剑桥大学，任北京协和医学院助理教授，博士生导师，中国医药生物技术协会基因检测分会委员，世界华人医师协会前沿技术临床转化委员会委员，重大疾病共性机制研究全国重点实验室成员、《国际生物医学工程杂志》编委会委员。课题组具备生物信息学、计算生物学、网络编程的交叉背景。熟悉并深度应用前沿测序技术，如单细胞转录组、单细胞表观组、单细胞多组学、空间转录组测序。在此基础上，运用深度学习技术（如图神经网络GNN、变分自编码器VAE、基于Transformer的模型等）对这些复杂多维数据进行深度挖掘与整合：利用GNN建模细胞间通讯网络或基因调控网络，揭示细胞异质性、相互作用及空间组织结构；通过VAE实现基因组、转录组、蛋白质组等多层次异构数据的有效整合、降维与特征提取，降低噪声并捕获关键生物学模式；借助Transformer模型捕获不同分子层面间（如基因-表观调控）的长距离依赖关系，深化对细胞状态动态变化和调控机制的理解。融合这些高通量实验技术与AI驱动的分析方法，对神经退行性疾病和免疫系统疾病展开一系列研究。在Nature Communications、Nucleic Acids Research、Science Bulletin等杂志发表多篇论文。以项目负责人或者课题负责人身份主持了“国家重点研发计划”、“国家自然科学基金”、“中国博士后科学基金”等多项国家级科研项目。

团队简介

Team Profile

计算团队核心成员聚焦于计算机科学、人工智能（AI）与生物医学的交叉融合研究，致力于揭示复杂疾病发病机制，推动医疗水平提升。迄今以第一作者（含共一）或通讯作者（含共通讯）身份，在生物信息学相关的中科院一区SCI期刊发表论文6篇、二区SCI期刊论文3篇、EI论文4篇；其中4篇入选ESI高被引论文。总被引次数（谷歌学术）超过2500次，H指数为19。