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中国医学科学院药用植物研究所研究员,博士生导师,“协和学者”特聘教授,生物信息学中心副主任。南开大学理学学士,专业为微生物学;美国明尼苏达大学理学博士,专业为动物病理学;美国明尼苏达大学理学硕士,专业为计算机科学(第二学位)。曾任GlaxoSmithKline(Research Triangle Park, North Carolina, USA)研发部项目经理、香港大学李嘉诚医学院研究助理教授,耶鲁大学访问学者。 主持及参加国家自然科学基金项目、北京市自然科学基金项目、香港General ResearchFund、科技部科技基础资源调查项目、科技部重大新药创制项目、教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目、人力资源与社会保障部留学人员科技活动项目择优资助项目、中国医学科学院医学与健康创新工程项目、中国医学科学院协和学者特聘教授资助项目、中国医学科学院中药资源学协和创新团队项目等科研项目30余项。获得中华中医药学会科学技术奖一等奖、教育部科学技术进步奖一等奖。 发表论文90余篇,载文刊物包括Nature Communication、Nucleic Acids Research、Science、PNAS、Molecular Ecology Resource、BMC Genomics等。科研论文总被引次数大于5000次,其中3篇为ESI高被引论文, 4篇引用次数》100。开发了一系列生物信息数据分析工具,其中叶绿体基因组注释与分析系列工具cpgavas及cpgavas2在全球范围内被广泛使用。目前作为主编出版专著两部,获得软件著作权10项,获得专利授权5项。 作为联络人推动中国医学科学院药用植物研究所(IMPLAD)与美国Illumina公司签署协议,启动国际千种药用植物基因组计划(1000 Medicinal Plant Genomes,简称1KMPG),创建世界首个药用植物参考基因库,并建立1KMPG国际联盟。 自2019年12月担任SCI期刊Mitochondrial DNA Part B-Resources执行编辑、主编(Taylor & Francis出版集团)(https://www.tandfonline.com/action/journalInformation?show=editorialBoard&journalCode=tmdn20)。
团队简介
Team Profile
待补充更新
硕士研究生 3 名,博士研究生 3 名
# | 项目名称 | 起止日期 | 金额 | 项目类型 | 本人角色 |
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1 | 灵芝环状RNA23316以竞争性内源RNA方式结合milRNA117调控鲨烯环氧 酶影响三萜类化合物合成的机制研究 | 2019-01 —— 2023-12 | 56 | 主持在研的国家或省部级科研项目 | 主持人 |
2 | “一带一路”国家传统草药数据库与共享平台建设 | 2019-01 —— 2024-12 | 50 | 参与在研的国家或省部级科研项目 | 参与 |
3 | 南岭优势及特色药用植物全产业链关键技术 研发 | 2024-04 —— 2027-04 | 15 | 参与在研的国家或省部级科研项目 | 课题负责人 |
# | 论文题目 | 期刊名称 | 发表年份 | 论文署名 |
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1 | Complete mitochondrial genome of Mentha spicata L. reveals multiple chromosomal configurations and RNA editing events | International Journal of Biological Macromolecules | 2023-08 | 通讯作者 |
2 | The mitochondrial genomes of Panax notoginseng reveal recombination mediated by repeats associated with DNA replication | International Journal of Biological Macromolecules | 2023-08 | 通讯作者 |
3 | CPGView: A package for visualizing detailed chloroplast genome structures | Molecular Ecology Resources | 2023-01 | 通讯作者 |
4 | Plant mitochondrial genome map (PMGmap): A software tool for the comprehensive visualization of coding, noncoding and genome features of plant mitochondrial genomes | Molecular Ecology Resources | 2024-03 | 通讯作者 |
5 | CPGAVAS2, an integrated plastome sequence annotator and analyzer | Nucleic Acids Research | 2019-05 | 通讯作者 |
无
# | 成果类型 | 项目/专利/新品种名称 |
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1 | 出版高水平专著 | 中国药用植物叶绿体基因组图谱《第一册》 |
2 | 出版高水平专著 | 中国药用植物叶绿体基因组图谱《第二册》 |
3 | 出版高水平专著 | The Lingzhi Mushroom Genome |