导师风采
宋经元

个人信息

Personal Information

  • 性别:男
  • 导师类型:博士生导师
  • 职称:研究员
  • 该职称任职时间:20110930

联系方式

Contact Information

  • 所属院系:药用植物研究所
  • 所属专业:药学
  • 邮箱 : jysong@implad.ac.cn
  • 工作电话 : 010-57833199

个人简介

Personal Profile

宋经元,1969年出生,籍贯湖北当阳市,中药资源学专家,药用植物研究所研究员,博士生导师。1987年考入北京农业大学(现中国农业大学)植物生理生化专业,1991年获学士学位。1995-1998年、1999-2002年在北京协和医学院生药学专业先后攻读硕士和博士学位,从事药用植物生物技术研究。1998年升为助理研究员。2004年进入美国北卡罗莱纳州立大学进行博士后研究,主要研究木本植物功能基因组。2006年升为副研究员。2011年升为研究员。2016年作为高级研究学者(CSC资助)赴美国哈佛大学医学院访问,主要研究基因组编辑。入围2022年全球前2%顶尖科学家“职业生涯影响力”和“年度影响力”榜单。 享受国务院政府特殊津贴,入选国家百千万人才工程、国家人力资源和社会保障部有突出贡献中青年专家、国家卫生计生委突出贡献中青年专家、北京协和医学院优秀教师、北京协和医学院“教书育人先锋”、北京市科技新星。担任教育部“中药资源工程研究中心”主任,国家中医药管理局“中药资源保护重点研究室”主任。 秉承协和小规模特色教学理念,保护学生个性化发展,鼓励学生参与国际会议作口头报告;支持学生赴国外联合培养,开拓国际视野;指导学生申报并获研究生创新基金。现已指导毕业14名硕博士研究生,其中4人次获国家奖学金,9人次获北京市或校级优秀毕业生称号,毕业生主要就业方向为高校及科研院所。

团队简介

Team Profile

团队在国际上提出并验证ITS2序列作为植物通用DNA 条形码,创建中草药DNA条形码物种鉴定体系、纳入《中华人民共和国药典》指导原则,入选2014年“世界中医药十大新闻”、2016年“中国十大医学进展”,获国家科技进步二等奖1项、省部级一等奖3项。创建《本草基因组学》学科,编著全国高等医药院校规划教材《本草基因组学》。突破复杂药用植物基因组结构解析技术,搭建高杂合度药用植物基因组研究平台,完成半枝莲、丹参、茯苓、黄芩、金银花、卷柏、灵芝、毛黄堇、西红花、栀子等药用物种全基因组图谱绘制工作。提出全新的基于全基因组分析的物种鉴定新方法——时珍法,为动、植物和真菌物种分类及多样性研究提供高效、准确的方法,成功开启以全基因组为核心的下一代物种鉴定新模式。

  • 研究方向Research Directions
中药资源与鉴定,药用植物功能基因组
  • 在校研究生Current Graduate Students

硕士研究生 5 名,博士研究生 5 名

  • 科研项目Research Projects
# 项目名称 起止日期 金额 项目类型 本人角色
1西红花苷生物合成两个关键酶的催化机制一致性研究2021-01-01 —— 2024-12-3156.0万元主持在研的国家或省部级科研项目主持者
2西红花苷生物合成糖基转移酶挖掘及功能验证2023-01 —— 2024-1228.0万元主持在研的国家或省部级科研项目主持人
3新疆阿魏等特色濒危药用植物优良种质选育2023-11 —— 2028-1036.15万元参与在研的国家或省部级科研项目参与人
  • 发表论文Papers
# 论文题目 期刊名称 发表年份 论文署名
1Biomonitoring for traditional herbal medicinal products using DNA metabarcoding and single molecule, real-time sequencingActa Pharm Sin B2018-06宋经元
2Genome Analysis of the Ancient Tracheophyte Selaginella tamariscina Reveals Evolutionary Features Relevant to the Acquisition of Desiccation ToleranceMolecular Plant2018-05宋经元
3The AP2/ERF transcription factor SmERF128 positively regulates diterpenoid biosynthesis in Salvia miltiorrhizaPlant Mol Biol 2019-03宋经元
4Comparative Genome Analysis of Scutellaria baicalensis and Scutellaria barbata Reveals the Evolution of Active Flavonoid BiosynthesisGenomics Proteomics Bioinformatics2020-06宋经元
5The Wolfiporia cocos Genome and Transcriptome Shed Light on the Formation of Its Edible and Medicinal SclerotiumGenomics Proteomics Bioinformatics2020-08宋经元
6Trends in herbgenomicsSci China Life Sci2019-04宋经元
7Tandem gene duplications drive divergent evolution of caffeine and crocin biosynthetic pathways in plantsBMC Biol2020-06宋经元
8Comparative genomics reveal the convergent evolution of CYP82D and CYP706X members related to flavone biosynthesis in Lamiaceae and AsteraceaePlant Journal2022-03宋经元
9Genome-wide identification and analysis of AP2/ERF transcription factors related to camptothecin biosynthesis in Camptotheca acuminataChin J Nat Med2020-08宋经元
10Highly variable chloroplast genome from two endangered Papaveraceae lithophytes Corydalis tomentella and Corydalis saxicolaEcol Evol2021-03宋经元
11Precise species detection of traditional Chinese patent medicine by shotgun metagenomic sequencingPhytomedicine2018-04宋经元
12The honeysuckle genome provides insight into the molecular mechanism of carotenoid metabolism underlying dynamic flower colorationNew Phytol2020-08宋经元
13In ivo production of five crocins in the engineered Escherichia coliACS Synth Biol2020-05宋经元
14Introduction of mutations in plants with prime editingMethods2021-10宋经元
15Genomic survey of bZIP transcription factor genes related to tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhizaActa Pharm Sin B2018-03宋经元
16The genome of Corydalis reveals the evolution of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in RanunculalesPlant Journal2022-07宋经元
17DNA barcoding of Corydalis, the most taxonomically complicated genus of PapaveraceaeEcol Evol2019-01宋经元
18GAGE is a method for identification of plant species based on whole genome analysis and genome editingCommunications Biology2022-09宋经元
19Application of DNA barcoding to the entire traditional Chinese medicine industrial chain: A case study of Rhei Radix et RhizomaPhytomedicine2022-10宋经元
20Crocus genome reveals the evolutionary origin of crocin biosynthesisActa Pharm Sin B2024-04宋经元
  • 科研获奖Research Awards
# 获奖证书编号 奖项名称 获奖级别 获奖类别 获奖等级 获奖日期 颁奖单位 本单位是否为第一完成单位 完成单位排名 本人排序 备注
1062018S-003中草药国际通用DNA条形码鉴定体系省部级其他省部级奖励一等奖2018-12-08世界中医药学会联合会22
2004国家药品标准分子核酸检测技术体系的构建与应用省部级其他省部级奖励二等奖2020-09-01中国药学会59
32016-J-234-2-02-R02中草药DNA条形码物种鉴定体系国家级国家最高科学技术奖、自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖二等奖2016-12-21国务院12
42022-J-2-45-R02基于生物技术的中药资源利用与质控新方法及运用省部级科技进步奖二等奖2023-03-01四川省人民政府22
5中草药DNA条形码生物鉴定体系省部级其他省部级奖励一等奖2014-11-01中华中医药学会12
62014-204中草药DNA条形码生物鉴定体系省部级教育部科学技术进步奖一等奖2015-02-09中华人民共和国教育部12
  • 研究成果Research Findings
# 成果类型 项目/专利/新品种名称
1作为主创人员获得授权的发明专利和新品种参与西红花苷合成的两个糖基转移酶GjUGT94E13和GjUGT74F8的筛选鉴定及应用
2作为主创人员获得授权的发明专利和新品种一种丹参AP2转录因子SmERF128编码序列及克隆方法与应用
3出版高水平专著长白山药用植物图鉴及DNA条形码
4获得省部级及以上科研奖励基于生物技术的中药资源利用与控制新方法及运用
5出版高水平专著药用植物分子遗传学
6作为主创人员获得授权的发明专利和新品种渝栀3号
7作为主创人员获得授权的发明专利和新品种基于全基因组分析的真核生物物种鉴定方法及应用
8作为主创人员获得授权的发明专利和新品种基于全基因组分析与基因组编辑的植物物种鉴定方法与应用
9作为主创人员获得授权的发明专利和新品种基于时珍法鉴定鹿科动物的物种特异性靶标序列、试剂盒及应用
10作为主创人员获得授权的发明专利和新品种基于时珍法的真菌物种鉴定方法、靶标核苷酸、引物对、试剂盒及其应用
11作为主创人员获得授权的发明专利和新品种基于时珍法的中药鉴定方法及应用
12作为主创人员获得授权的发明专利和新品种一种鉴别大黄药材三个基原物种的方法与应用
13作为主创人员获得授权的发明专利和新品种Method for controlling the quality of traditional Chinese patent medicines based on metagenomics