导师风采
陈阳
个人信息
Personal Information
- 性别：男
- 导师类型：博士生导师
- 职称：副研究员
- 该职称任职时间：2020
联系方式
Contact Information
- 所属院系：基础学院
- 所属专业：生物化学与分子生物学
- 邮箱 : yc@ibms.pumc.edu.cn
- 工作电话 : 010-69156430
个人简介
Personal Profile
1999.09-2002.06就读于中山大学主修药学专业，辅修计算机专业，获学士学位；2002.09-2005.06就读于北京协和医学院, 免疫学专业，获硕士学位；2005.09-2008.06就读于北京协和医学院，生化与分子生物学专业，获博士学位。2008.09-2011.07清华大学-自动化系，从事生物信息学博士后研究。2011.08-2020.12清华大学信息国家研究中心生物信息学研究部历任助理研究员、副研究员，从事基因组与生物信息学研究。2020.12-至今，北京协和医学院生化系，研究员，分子系统生物学课题组PI，从事基因组空间结构与功能相关的分子系统生物学研究和教学工作。
团队简介
Team Profile
待补充更新
- 研究方向Research Directions
人工智能与分子生物学
- 在校研究生Current Graduate Students
硕士研究生 4 名，博士研究生 3 名
- 科研项目Research Projects
| # | 项目名称 | 起止日期 | 金额 | 项目类型 | 本人角色 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 生物空间组学技术与生物信息方法研究 | 2021-09 —— 2025-08 | 400 | 主持在研的国家或省部级科研项目 | 主持 |
| 2 | 真核细胞染色质空间结构精准编辑技术研究 | 2022-07 —— 2024-06 | 50 | 主持在研的国家或省部级科研项目 | 主持 |
| 3 | 多风险因素影响脑稳态的机理及干预研究 | 2021-01 —— 2025-12 | 40 | 参与在研的国家或省部级科研项目 | 参与 |
- 发表论文Papers
| # | 论文题目 | 期刊名称 | 发表年份 | 论文署名 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Quantifying the phase separation property of chromatin-associated proteins under physiological conditions using an anti-1,6-hexanediol index. | Genome Biology | 2021-08 | 通讯 |
| 2 | SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment. | Nature Methods | 2021-10 | 通讯 |
| 3 | CASPIAN: A Method to Identify Chromatin Topological Associated Domains based on Spatial Density Cluster. | Computational and Structural Biotechnology Journal | 2022-09 | 通讯 |
| 4 | MyoD is a 3D genome structure organizer for muscle cell identity. | Nature Communications | 2022-01 | 通讯 |
| 5 | Temporal transcriptomic dynamics in developing macaque neocortex. | eLife | 2024-02 | 通讯 |
- 科研获奖Research Awards
| # | 获奖证书编号 | 奖项名称 | 获奖级别 | 获奖类别 | 获奖等级 | 获奖日期 | 颁奖单位 | 本单位是否为第一完成单位 | 完成单位排名 | 本人排序 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | iGEM国际基因工程机器大赛2018 | 国际级 | 一等奖 | 2018-10-24 | 美国麻省理工学院 | 否 | |||||
| 2 | 2021年度中国生物信息学十大进展 | 省部级以下 | 年度中国生物信息学十大进展 | 特等奖 | 2022-02-01 | 基因组蛋白质组与生物信息学报 | 否 | ||||
| 3 | 2018年度中国生物信息学十大进展 | 省部级以下 | 年度中国生物信息学十大进展 | 特等奖 | 2019-02-01 | 基因组蛋白质组与生物信息学报 | 否 | ||||
| 4 | iGEM国际基因工程机器大赛2022 | 国际级 | 三等奖 | 2022-10-26 | 美国麻省理工学院 | 是 | 1 | 1 | |||
| 5 | NDC21Al10000359 | 第七届大学生基础医学创新研究 | 国家级 | 其他 | 2021-02-01 | 高等学校国家级实验整学示范中心联席会 | 是 | 1 | 1 |
- 研究成果Research Findings
| # | 成果类型 | 项目/专利/新品种名称 |
|---|---|---|
| 1 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 基因调控性染色质相互作用的鉴定方法、系统及其应用 |
| 2 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 一种核酸复合体中核酸区段相互作用的分析方法 |
| 3 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 一种染色质拓扑结构域边界的分析方法 |