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个人简介
Personal Profile
夏杰,江苏苏州人,现任职于中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所,研究员(资格)、硕士生导师、五级课题组长。2015年毕业于北京大学药学院,获药物化学专业博士学位(导师:张亮仁教授)。2012-2014作为公派联合培养博士生在美国华盛顿哥伦比亚特区AIDS研究中心(DC CFAR)学习分子信息学与计算机科学。 研究方向为基于人工智能的药物设计新方法研究及新药研发实践,尤其擅长药物设计软件的编程开发及应用。作为编委会成员参编《常用计算机辅助药物设计软件教程》;已以第一或通讯作者在J. Med. Chem.、J. Chem. Inf. Model. 、Eur. J. Med. Chem.等专业期刊发表SCI论文近30篇,其中3篇论文入选期刊封面;主导研发2款面向药物设计的计算机软件,软件《MUBD-DecoyMaker》相关论文被选为ESI 高被引论文/他引过百论文,软件《AutoMoIDesigner》荣获工业和信息化部全国仿真创新应用大赛全国总决赛一等奖(药学方向第1名),为解决药物设计领域数据小、多目标优化问题提供了方法;设计并发现多个先导物,其中1个先导物被国际知名化学评论期刊Synfacts作为亮点评述、作为主要发明人(排名前3)获得授权专利7项;参与新药研发项目2项,其中治疗非酒精性肝炎药物 IMM-H014已进入 I 期临床试验、靶向整合素小分子抑制剂已实现成果转化;主持了国家自然科学基金面上/青年项目、国家外国专家项目、重大新药创制国家重大专项子任务等国家级科研项目;兼任中国仿真学会仿真数字资源专委会委员、《中国医药生物技术》等中国科技核心期刊编委。
团队简介
Team Profile
本团队具备从事新药研发所必需的高水平技术平台(人工智能药物设计技术平台、药物合成和药学研究平台、药物生物活性评价合作平台),长期从事药物化学研究与新药开发,具有丰富的新药研发经验,研发的治疗脑卒中创新药物匹诺赛林及其冻干粉针剂已由国家药品监督管理局批准进入II期临床研究、研发的降血脂创新药物IMM-H007已经完成I期临床研究,治疗非酒精性肝炎创新药物IMM-H014已进入I期临床研究。 本团队与北京大学药学院张亮仁教授课题组、美国华盛顿哥伦比亚特区AIDS研究中心Simon Wang课题组、奥地利维也纳大学 Johannes Kirchmair 课题组、德国亥姆霍兹-慕尼黑研究中心结构生物学研究所 Igor Tetko课题组、美国杜克大学医学院Pei Zhou教授建立了长期的科研合作关系,多名学生进入北京大学、德国波恩大学、比利时鲁汶大学等国内外知名高校攻读博士学位(1名已回国任985高校独立课题组长)。
硕士研究生 3 名,博士研究生 0 名
| # | 项目名称 | 起止日期 | 金额 | 项目类型 | 本人角色 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 国家外国专家项目:基于人工智能的药物发现技术研究 | 2024-01 —— 2025-12 | 主持在研的国家或省部级科研项目 | 项目负责人 |
| # | 论文题目 | 期刊名称 | 发表年份 | 论文署名 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Tao Shen, Jiale Guo, Zunsheng Han, Gao Zhang, Qingxin Liu, Xinxin Si, Dongmei Wang*, Song Wu*, Jie Xia*. AutoMolDesigner for Antibiotic Discovery: An AI-Based Open-Source Software for Automated Design of Small-Molecule Antibiotics, Journal of Chemical Information and Modeling, 2024, 64(3): 575-583 | Journal of Chemical Information and Modeling | 2024-02 | 通讯作者 |
| 2 | Tao Shen, Shan Li, Xiang Simon Wang, Dongmei Wang*, Song Wu*, Jie Xia*, Liangren Zhang, Deep reinforcement learning enables better bias control in benchmark for virtual screening, Computers in Biology and Medicine, 2024, 171, 108165. | Computers in Biology and Medicine | 2024-03 | 通讯作者 |
| 3 | Tong Qin#, Xuefeng Gao#, Lei Lei, Jing Feng, Wenxuan Zhang, Yuhua Hu, Zhufang Shen, Zhenming Liu, Yi Huan*, Song Wu*, Jie Xia*, Liangren Zhang, Machine learning- and structure-based discovery of a novel chemotype as FXR agonists for potential treatment of nonalcoholic fatty liver disease. European Journal of Medicinal Chemistry, 2023, 252: 115307. | European Journal of Medicinal Chemistry | 2023-04 | 通讯作者 |
| 4 | Tong Qin#, Xuefeng Gao#, Lei Lei, Wenxuan Zhang, Jing Feng, Xing Wang, Zhufang Shen, Zhenming Liu, Yi Huan*, Song Wu*, Jie Xia*, Liangren Zhang, Structural optimization and biological evaluation of 1-adamantylcarbonyl-4-phenylpiperazine derivatives as FXR agonists for NAFLD, European Journal of Medicinal Chemistry, 2023, 245: 114903. | European Journal of Medicinal Chemistry | 2023-01 | 通讯作者 |
| 5 | Lei Xu; Yaling Wang; Sangyu Hu; Yuzhu Pei; Chenliang Qian; Wenjie Xue; Gao Zhang; Song Wu; Xinxin Si; Xuming Deng; Jie Xia*; Jianfeng Wang* ; Discovery of Metabolic Reprogramming 2-Quinolones as Effective Antimicrobials for MRSA-Infected Wound Therapy, Journal of Medicinal Chemistry, 2025, 68(3): 3004-3019 | Journal of Medicinal Chemistry | 2025-01 | 通讯作者 |
| # | 获奖证书编号 | 奖项名称 | 获奖级别 | 获奖类别 | 获奖等级 | 获奖日期 | 颁奖单位 | 本单位是否为第一完成单位 | 完成单位排名 | 本人排序 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | IITCHJSIAC24001856 | 小分子抗菌药物AI自动设计软件AutoMolDesigner© | 省部级 | 个人奖励 | 一等奖 | 2024-11-25 | 工业和信息化部人才交流中心 | 是 | 1 | 1 |
| # | 成果类型 | 项目/专利/新品种名称 |
|---|---|---|
| 1 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 1. 芳基或杂芳基取代的噻二唑类化合物及其抗菌用途,ZL201910672950.1 |
| 2 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 2. 芳基或杂芳基取代的喹喔啉-2,3-二胺类化合物及其抗菌用途,ZL202011130881.0 |
| 3 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 3. 4-肉桂基-3-羟基吡咯酮类化合物在制备糖尿病治疗药物中的应用,ZL202010882915.5 |
| 4 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 4. 软件著作权登记证书,基于深度生成模型的全新药物分子设计软件[简称: AutoMolDesigner] V1.0,2023SR1040550 |
| 5 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 5. 软件著作权登记证书,面向药物发现的最大无偏好性基准数据集计算软件[简称: MUBD-DecoyMaker] V3.0,2023SR0300248 |