个人信息
Personal Information
联系方式
Contact Information
个人简介
Personal Profile
女,博士,课题组组长,研究员,博士生导师。先后就读于山东大学药学院(1998-2002,学士学位)和北京协和医学院(2002-2007,博士学位);2007年起于中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所从事科研教学工作,2017年赴澳大利亚昆士兰大学进行代谢组学方向的访学研究。主要研究方向为抗感染、抗肿瘤及降脂微生物药物的发现,在传统活性导向先导化合物发现的基础上,将近年来发展起来的基因组测序技术、生物信息学、合成生物学与代谢组学技术结合起来,尤其是利用基于人工智能的代谢组学技术,建立更高效的药物先导化合物发现平台。目前已建立多种高效分析方法(详见文章),同时开发了多个化学生物信息学工具, 如: 1. 基于深度学习的卤化物挖掘工具DeepHalo (https://github.com/xieyying/DeepHalo,软著:2025SR0967337) 2. 质谱前处理工具mzml2gnps (https://pypi.org/project/mzml2gnps); 3. 网页版的官能团生物合成检索工具FunGBE (Function Group Biosynthesis Explorer: http://www.npba-xielab.com:8502) 4. 基于比较基因组的孤儿基因簇分析工具phyloBGC (https://github.com/xieyying/phyloBGC)
团队简介
Team Profile
待补充更新
硕士研究生 2 名,博士研究生 0 名
# | 项目名称 | 起止日期 | 金额 | 项目类型 | 本人角色 |
---|---|---|---|---|---|
1 | 天然药物微量、水溶性药效物质发现与药效评价新技术研究 | 2021-10-01 —— 2025-12-31 | 6000.0 | 参与在研的国家或省部级科研项目 | 参与者 |
# | 论文题目 | 期刊名称 | 发表年份 | 论文署名 |
---|---|---|---|---|
1 | Bioactivity-Based Molecular Networking-Guided Isolation of Epicolidines A–C from the Endophytic Fungus Epicoccum sp. 1-042 | Journal of Natural Products | 2024-05 | 通讯作者 |
2 | Molecular Networking-Based Screening Led to the Discovery of a Cyclic Heptadepsipeptide from an Endolichenic Xylaria sp. | Journal of Natural Products | 2022-04 | 通讯作者 |
3 | Application of Untargeted Tandem Mass Spectrometry with Molecular Networking for Detection of Enniatins and Beauvericins from Complex Samples | Journal of Chromatography A | 2022-06-09 | 通讯作者 |
4 | Genome-Directed Discovery of Bicyclic Cinnamoyl-Containing Nonribosomal Peptides with Anticoronaviral Activity from Streptomyces griseus | Organic Letters | 2023-07 | 通讯作者 |
5 | Pairing comparative genomics with tandem mass-based molecular networking allows to highly efficient discovery of nonribosomal peptides from Nocardia spp | Journal of Chromatography A | 2020-10 | 通讯作者 |
无
# | 成果类型 | 项目/专利/新品种名称 |
---|---|---|
1 | 作为主创人员获得授权的发明专利和新品种 | 卤化物高通量分析系统 [简称:DeepHalo] V1.0 |