导师风采
解云英

个人信息

Personal Information

  • 性别:女
  • 导师类型:博导
  • 职称:研究员
  • 该职称任职时间:20200930

联系方式

Contact Information

  • 所属院系:医药生物技术研究所
  • 所属专业:微生物与生化药学
  • 邮箱 : xieyy@imb.pumc.edu.cn
  • 工作电话 : 19790919

个人简介

Personal Profile

女,博士,课题组组长,研究员,博士生导师。先后就读于山东大学药学院(1998-2002,学士学位)和北京协和医学院(2002-2007,博士学位);2007年起于中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所从事科研教学工作,2017年赴澳大利亚昆士兰大学进行代谢组学方向的访学研究。主要研究方向为抗感染、抗肿瘤及降脂微生物药物的发现,在传统活性导向先导化合物发现的基础上,将近年来发展起来的基因组测序技术、生物信息学、合成生物学与代谢组学技术结合起来,尤其是利用基于人工智能的代谢组学技术,建立更高效的药物先导化合物发现平台。目前已建立多种高效分析方法(详见文章),同时开发了多个化学生物信息学工具, 如: 1. 基于深度学习的卤化物挖掘工具DeepHalo (https://github.com/xieyying/DeepHalo,软著:2025SR0967337) 2. 质谱前处理工具mzml2gnps (https://pypi.org/project/mzml2gnps); 3. 网页版的官能团生物合成检索工具FunGBE (Function Group Biosynthesis Explorer: http://www.npba-xielab.com:8502) 4. 基于比较基因组的孤儿基因簇分析工具phyloBGC (https://github.com/xieyying/phyloBGC)

团队简介

Team Profile

待补充更新

  • 研究方向Research Directions
微生物药物研究, 微生物天然产物基因组挖掘, 基于人工智能的代谢组方法开发
  • 在校研究生Current Graduate Students

硕士研究生 2 名,博士研究生 0 名

  • 科研项目Research Projects
# 项目名称 起止日期 金额 项目类型 本人角色
1天然药物微量、水溶性药效物质发现与药效评价新技术研究2021-10-01 —— 2025-12-316000.0参与在研的国家或省部级科研项目参与者
  • 发表论文Papers
# 论文题目 期刊名称 发表年份 论文署名
1Bioactivity-Based Molecular Networking-Guided Isolation of Epicolidines A–C from the Endophytic Fungus Epicoccum sp. 1-042Journal of Natural Products2024-05通讯作者
2Molecular Networking-Based Screening Led to the Discovery of a Cyclic Heptadepsipeptide from an Endolichenic Xylaria sp.Journal of Natural Products2022-04通讯作者
3Application of Untargeted Tandem Mass Spectrometry with Molecular Networking for Detection of Enniatins and Beauvericins from Complex SamplesJournal of Chromatography A2022-06-09通讯作者
4Genome-Directed Discovery of Bicyclic Cinnamoyl-Containing Nonribosomal Peptides with Anticoronaviral Activity from Streptomyces griseusOrganic Letters2023-07通讯作者
5Pairing comparative genomics with tandem mass-based molecular networking allows to highly efficient discovery of nonribosomal peptides from Nocardia sppJournal of Chromatography A2020-10通讯作者
  • 科研获奖Research Awards


  • 研究成果Research Findings
# 成果类型 项目/专利/新品种名称
1作为主创人员获得授权的发明专利和新品种卤化物高通量分析系统 [简称:DeepHalo] V1.0