导师风采
林东昕

个人信息

Personal Information

  • 性别:男
  • 导师类型:博士生导师
  • 职称:教授
  • 该职称任职时间:19970301

联系方式

Contact Information

  • 所属院系:肿瘤医院
  • 所属专业:
  • 邮箱 : lindx@cicams.ac.cn
  • 工作电话 : 010-87788349

个人简介

Personal Profile

林东昕, 1955年10月24日出生,男,汉族,福建省福州市人,肿瘤遗传学及基因组学专家。中共党员。1980年毕业于上海第一医学院,1986年毕业于北京医科大学研究生院获医学硕士学位。1988年至1994年先后在法国国家肿瘤研究所、WHO国际癌症研究中心(IARC)和美国国家毒理学研究中心从事肿瘤基础研究工作。1995年受聘到中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所工作,先后任副研究员、研究员。现任中国医学科学院北京协和医学院终身教授、中山大学华南肿瘤学国家重点实验室研究员、中国医学科学院肿瘤医院病因及癌变研究室主任、癌发生及预防分子机理北京市重点实验室主任;兼任中国病生理学会肿瘤专业委员会主任委员、中国抗癌协会常务理事、中国环境诱变剂学会副主任委员、中国医学科学院学术委员会委员、北京大学医学部学术委员会委员,中山大学学术委员会委员、分子肿瘤学国家重点实验室学术委员会副主任。林东昕院士长期从事恶性肿瘤发生发展的分子机制及其遗传易感性研究。主要学术贡献是揭示并阐明我国食管癌、胰腺癌、肺癌等常见肿瘤的基因组变异,基因与环境的交互作用,以及基因组变异对肿瘤放化疗疗效和预后的影响。已在Nature、Nature Genetics等期刊发表科学论文300余篇, H-指数85。研究成果获国家自然科学奖二等奖2项(2013年,2006年)、国家科技进步奖一等奖1项(2013年)、国家科技进步奖二等奖2项(2008年,2019年)、教育部自然科学奖一等奖2项(2011年,2015年)等。1998年国家杰出青年科学基金获得者,1999年入选国家级百千万人才工程,国务院颁发政府特殊津贴专家(2001年),卫生部有突出贡献中青年专家(2004年),国家科技部“973”基础研究先进个人(2004年),北京市先进工作者(2010年),全国优秀科技工作者(2010年)。2013年当选中国工程院院士。

团队简介

Team Profile

林东昕教授课题组主要开展全基因组结构和功能改变与肿瘤发生发展以及个体化治疗的研究,以发现食管癌、胰腺癌和肺癌等常见恶性肿瘤发生发展相关基因以及与个体放化疗疗效差异相关的遗传变异;建立肿瘤发生发展风险评估和放化疗疗效预测的生物标志。还开展肿瘤基因异常表达的分子机制研究:运用新一代测序等技术平台,在全基因组水平研究特定肿瘤组织中表达失调基因的遗传和表遗传改变,整体上阐明肿瘤发生发展中基因表达异常的机制,为预防、个体化治疗和发现药物和治疗靶点提供新思路。

  • 研究方向Research Directions
全基因组和转录组改变与肿瘤发生发展研究, 个体化治疗的基础研究
  • 在校研究生Current Graduate Students

硕士研究生 0 名,博士研究生 18 名

  • 科研项目Research Projects
# 项目名称 起止日期 金额 项目类型 本人角色
1肿瘤的分子变异与微环境2020-01-01 —— 1500.0
  • 发表论文Papers
# 论文题目 期刊名称 发表年份 论文署名
1Excessive miR-25-3p maturation via N6-methyladenosine stimulated by cigarette smoke promotes pancreatic cancer progression.Nature Communications.2019-02林东昕
2Genetic risk of extranodal natural killer T-cell lymphoma: a genome-wide association study in multiple populations. Lancet Oncol.2020-02林东昕
3Inflammatory cytokine-regulated tRNA-derived fragment tRF-21 suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression.J Clin Invest 2021-05林东昕
4Dissecting esophageal squamous-cell carcinoma ecosystem by single-cell transcriptomic analysis.Nat Commun2021-05林东昕
5BRCA1-associated protein increases invasiveness of esophageal squamous cell carcinoma.Gastroenterology.2017-03林东昕
6Genome-wide identification and characterization of circular RNA m6A modification in pancreatic cancer. Genome Med2021-09林东昕
7Exome-wide analysis identifies three low-frequency missense variants associated with pancreatic cancer risk in Chinese populations.Nat Commun.2018-08林东昕
8Functional role of PLCE1 intronic insertion variant associated with susceptibility to esophageal squamous-cell carcinoma.Carcinogenesis.2018-02林东昕
9Solute carrier family 39 member 6 gene promotes aggressiveness of esophageal carcinoma cells by increasing intracellular levels of Zinc, activating phosphatidylinositol 3-Kinase signaling, and up-regulating genes that regulate?metastasis.Gastroenterology2017-01林东昕
10Functional role of BTB and CNC Homology 1 gene in pancreatic cancer and its association with survival in patients treated with gemcitabine.Theranostics.2018-12林东昕
11Genome landscapes of rectal cancer before and after preoperative chemoradiotherapy.Theranostics.2019-09林东昕
12NSUN2-mediated RNA 5-methylcytosine promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via LIN28B-dependent GRB2 mRNA stabilization.Oncogene2021-06林东昕
13Multi-omic characterization of genome-wide abnormal DNA methylation reveals diagnostic and prognostic markers for esophageal squamous-cell carcinoma.Signal Transduct Target Ther.2022-07-13林东昕
14A body map of somatic mutagenesis in morphologically normal human tissues.Nature2021-05林东昕
15Genomic alterations and precise medicine of esophageal squamous cell carcinoma. Journal of Bio-X Research. 2018-01林东昕
16Integrative analysis of gene expression profiles reveals specific signaling pathways associated with pancreatic duct adenocarcinoma.Cancer Commun (Lond). 2018-01林东昕
17Metformin inhibits pancreatic cancer metastasis caused by SMAD4 deficiency and consequent HNF4G upregulation. Protein Cell2021-12林东昕
18Metabolic remodeling by TIGAR overexpression is a therapeutic target in esophageal squamous-cell carcinoma.Theranostics.2020-08林东昕
19LINC00842 inactivates transcription co-regulator PGC-1α to promote pancreatic cancer malignancy through metabolic remodeling. Nat Commun2021-09林东昕
20VAV2 is required for DNA repair and implicated in cancer radiotherapy resistance.Signal Transduct Target Ther 2021-09林东昕
21Single-cell transcriptomic analysis in a mouse model deciphers cell transition states in the multistep development of esophageal cancerNature Communications2020-01通讯作者
22A cis-eQTL in NSUN2 promotes esophageal squamous-cell carcinoma progression and radiochemotherapy resistance by mRNA-m5C methylationSignal Transduction and Targeted Therapy2022-07通讯作者
23Computational identification of preneoplastic cells displaying high stemness and risk of cancer progressionCancer Res.2022-07通讯作者
24Epithelial cells activite fibrolasts to promote esophageal cancer development.Cancer Cell2023-05通讯作者
25Comprehensive analyses reveal effects on tumor immune infiltration and immunotherapy response of APOBEC mutagenesis and its molecular mechanisms in esophageal squamous cell carcinomaInternational Journal of Biological Sciences2023-05通讯作者
26Refined expression quantitative trait locus analysis on adenocarcinoma at the gastroesophageal junction reveals susceptibility and prognostic markersFrontiers in Genetics2023-05通讯作者
27Collagen 1-mediated CXCL1 secretion in tumor cells activates fibroblasts to promote radioresistance of esophageal cancerCell Reports2023-10通讯作者
28Genomic alterations driving precancerous to cancerous lesions in esophageal cancer developmentCancer Cell2023-11通讯作者
29Aberrant epithelial cell interaction promotes esophageal squamous-cell carcinoma development and progressionSignal Transduction and Targeted Therapy2023-11通讯作者
30Alarmin S100A8 imparts chenoresistance of esophageal cancer by reprogramming cancer-associated fibroblastsCell Reports Medicine2024-06通讯作者
31Tumor initiation and early tumorigenesis: molecular mechanisms and interventional targetsSignal Transduction and Targeted Therapy2024-06通讯作者
  • 科研获奖Research Awards
# 获奖证书编号 奖项名称 获奖级别 获奖类别 获奖等级 获奖日期 颁奖单位 本单位是否为第一完成单位 完成单位排名 本人排序 备注
12019-J-233-2-03-D01-05 乳腺癌精准诊疗关键技术创新与应用国家级国家最高科学技术奖、自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖二等奖2019-12-18中华人民共和国国务院15
  • 研究成果Research Findings
# 成果类型 项目/专利/新品种名称
1作为主创人员获得授权的发明专利和新品种一种VAV2基因缺失的肿瘤细胞系
2作为主创人员获得授权的发明专利和新品种VAV2在预测患者放疗敏感性和预后中的用途
3作为主创人员获得授权的发明专利和新品种一组诊断食管癌的甲基化标志物
4作为主创人员获得授权的发明专利和新品种一组食管癌甲基化预后标志物及其应用